Эстонская олимпийская академия разработала определенные элементы, которые должны содержаться в программе школьных олимпийских игр. Программа разделена на две части: период олимпийского образования и cпортивный праздник . При составлении программы школьных олимпийских игр каждая школа должна учитывать собственные возможности.